Riesgo genético: mirar las células una a una
· Redacción de BehindLines
¿Por qué una diferencia en el ADN aumenta el riesgo de una enfermedad? Según el instituto Garvan, tres trabajos publicados el 28 de octubre en Nature buscan precisar la respuesta observando por separado las células inmunitarias. El proyecto australiano TenK10K estudia así los vínculos entre variaciones genéticas, actividad de los genes y funcionamiento de esas células.
Varias lecturas de un mismo genoma
En una presentación difundida por Medical Xpress, el instituto Garvan describe una primera fase con cerca de 2 000 australianos y más de cinco millones de células inmunitarias para medir la actividad de los genes. El objetivo del proyecto es llegar a 10 000 participantes.
Los tres estudios abordan aspectos complementarios: el efecto de variantes frecuentes o raras, el de secuencias de ADN repetidas y la accesibilidad de la cromatina, es decir, la organización del ADN que permite o limita el acceso a las regiones reguladoras. Presentación de Garvan.
El tipo de célula cambia la interpretación
El estudio sobre la cromatina precisa su propio perímetro: tras el control de calidad, el análisis principal conserva unos 3,5 millones de núcleos celulares procedentes de 922 donantes. Los investigadores distinguen 28 tipos de células inmunitarias.
Relacionan estos mapas con los datos sobre la expresión de los genes y con los estudios genéticos relativos a 16 enfermedades y 44 características de la sangre. Una región asociada a un riesgo puede así examinarse en el tipo de célula donde aparece su efecto, en lugar de en una muestra de sangre considerada como un conjunto uniforme. Estudio en acceso abierto.
Pistas que poner a prueba
Esta cartografía ofrece posibles mecanismos que explorar. La asociación de una variante, una región reguladora y un riesgo no basta, por sí sola, para establecer la eficacia de un medicamento.
Garvan prevé en particular ampliar la diversidad genética de los participantes. Es un límite concreto para la interpretación: el alcance de un mapa depende también de las poblaciones estudiadas. El interés inmediato es orientar mejor las investigaciones biológicas; un uso terapéutico exigiría validaciones adicionales.